Trường THCS Nguyễn Trãi được thành lập ngày 06 tháng 8 năm 2010 theo Quyết định 621 của UBND thị xã Chí Linh trên cơ sở sáp nhập hai trường THCS Bến Tắm, THCS Bắc An. Sau 7 năm xây dựng và trưởng thành, được sự quan tâm chỉ đạo của các cấp lãnh đạo Đảng, chính quyền, sự ủng hộ của các đoàn thể và các tổ chức xã hội cùng với sự cố gắng không mệt mỏi của các thầy cô giáo và các em học sinh, trường THCS Nguyễn Trãi phấn đấu đạt chuẩn Quốc gia vào năm 2017.
Hiện nay, toàn trường có 43 cán bộ giáo viên, đạt chuẩn 100%, trên chuẩn 86,04%. Hàng năm, 100% giáo viên xếp loại khá trở lên theo quy định chuẩn nghề nghiệp giáo viên trung học. Về cán bộ quản lý: Lãnh đạo nhà trường có 03 đ/c (01 đ/c Hiệu trưởng và 02 đ/c Phó hiệu trưởng), có trình độ chuyên môn Đại học, trung cấp lý luận chính trị, quản lý giáo dục. Phong trào thi đua dạy tốt, học tốt; nghiên cứu viết, áp dụng sáng kiến, các cuộc thi được nhà trường tham gia nhiệt tình, có trách nhiệm.
Chất lượng giáo dục của nhà trường ngày được nâng cao, có tính bền vững. Nhiều em học sinh của trường đã đạt thành tích cao trong các cuộc thi học sinh giỏi văn hóa, thể thao… Từ năm 2013 – 2014 đến nay nhà trường có 01 học sinh đạt giải khuyến khích cấp quốc gia môn Olympic Tiếng Anh trên mạng, 23 học sinh đạt HSG cấp tỉnh các môn văn hóa trong đó có 2 giải nhì, 7 giải ba, 14 giải Khuyến khích. Có 13 em học sinh đạt giải Điền kinh cấp tỉnh..... Chất lượng thi tuyển sinh lớp 10 THPT của trường luôn đứng ở tốp đầu của thị xã, và xếp trong tốp 100 trường THCS trong tỉnh và tăng dần theo các năm. Năm học 2017-2018 kết quả thi vào lớp 10 THPT của trường xếp thứ 41/272 các trường trên toàn tỉnh.
Ghi nhận và biểu dương kết quả phấn đấu của nhà trường, lãnh đạo các cấp các ngành đã công nhận và trao thưởng nhiều phần thưởng: Bốn năm liền nhà trường được công nhận Tập thể lao động xuất sắc; Công đoàn, Đoàn thanh niên, Liên đội đều đạt được Vững mạnh xuất sắc, được Liên đoàn lao động tỉnh, Hội đồng đội TW tặng cờ, bằng khen.
Tháng 7 năm 2017, trường THCS Nguyễn Trãi đã được UBND tỉnh công nhận danh hiệu trường đạt chuẩn Quốc gia. Đây thực sự là phần thưởng lớn lao đối với thầy và trò nhà trường, trong thời gian tiếp theo trường THCS Nguyễn Trãi sẽ nỗ lực hơn nữa để xây dựng trường thành một địa chỉ tin cậy với phụ huynh học sinh.